在高温超导材料领域取得重要进展,发现了第一个临界温度超过40K的非铜氧化物超导体，相关研究成果发表在2008年5月的Nature上，入选2008年度世界十大科技进展新闻、国内十大科技新闻。银河galaxy官网

　　在国际上首次实现单个分子内部的化学反应，成功实现了单分子自旋态的控制。成果发表于2005年9月的Science上，入选2005年度中国十大科技进展、国内十大科技新闻。

　　设计出国际上第一个量子路由器，并率先在北京网通公司商用通信网络上完成四用户量子密码通信网络的测试运行。

　　在国际上首次获得具有化学键分辨率的C60单分子图像，并发现二维C60点阵的一种新型取向畴结构，研究论文发表于2001年1月的Nature，被评选为2001年度中国十大科技进展新闻、中国基础研究十大新闻、中国高校十大科技进展。

　　找到一种海啸早期预警的方法，可以在地震发生后的25分钟内确定地震的破裂长度和持续时间等基本参数，从而为海啸提供早期预警，该研究成果发表于2005年5月的Nature。

　　成功制备出由6个光子极化状态相干叠加形成的“薛定谔猫态”，实现可以直接用于量子计算的六光子“簇态”。成果发表于2007年2月的Nature Physics，入选2007年中国十大科技进展，中国高校十大科技进展，中国基础研究十大新闻。

　　成功找到一种能携带胰岛素通过皮肤进入体内的透皮肽，可望有效治疗糖尿病。成果发表于2006年4月的Nature Biotechnology ,入选2006年度中国基础研究十大新闻。

　　运用独特的“企鹅考古”方法，通过3000年来企鹅种群数量变迁研究推演南极气候变化，成果发表于2000年10月的Nature，入选2000年中国高校十大科技进展，中科院在《2001年科学发展报告》中将其列为“2000年度中国科学家具有代表性的工作”。

　　建成大空间早期火灾智能监测与电气火灾隐患检测系统，形成火灾风险评估与性能化防火设计核心技术，成功用于人民大会堂、奥运场馆、中央电视台、国家“十五”期间建设的16个棉花储备库群等100多个重要场所。获2001年和2006年国家科技进步奖二等奖。

　　研制成功我国首台采用国产高性能通用处理器芯片“龙芯2F”和其他国产器件、设备和技术的万亿次高性能计算机“KD-50-I”，这是我国高性能计算机国产化的一次重要突破。

　　KD系列汉语文语转换系统被认定为“处于国际领先水平，同时在汉语文语转换的实用化方面走在世界前列”。该项目1999年获安徽省科技进步奖一等奖, 2002年获国家科技进步奖二等奖。